顱內頭痛是指外傷後發生的腦脊液瘺或腰椎穿刺，使腦脊液繼續從穿刺部位向脊膜腔外滲出過多，導致椎管內壓力下降，後顱窩疼痛敏感組織被牽拉向下而導致的頭痛。腰椎穿刺後出現頭痛常見。
除外傷後發生的腦脊液瘺外，常見病因為腰椎穿刺後頭痛。腰穿檢查時放液過多，或因術後腦脊液繼續從穿刺部位向脊膜腔外滲出，使椎管內壓力下降，後顱窩疼痛敏感組織被牽拉向下而導致頭痛。
通常在術後數小時內出現枕部或額部的鈍痛或搏動性痛，起坐或站位時頭痛加劇，平卧後好轉。一般在1～3天內自然恢復，少數病例可持續更長時間。可有眩暈和嘔吐，嚴重者可有意識障礙。
本病與其他類型的頭痛相鑒別，有無腰椎穿刺病史，測顱壓可資鑒別。
全頭痛：全頭痛包括緊張性頭痛、低顱壓性頭痛、感染性頭痛、高血壓性頭痛和腦腫瘤引起的頭痛。
深部性頭痛：深部性頭痛多見於腦膿腫、腦炎、腦腫瘤，並向同側外部放射。主要是由於顱內血液循環及腦脊液循環障礙以及顱內壓增高，刺激腦血管和腦膜引起的。
前額頭痛：長在前額部位的腦垂體腺瘤的增生而壓迫附近的組織而引起前額頭痛。
通常在術後數小時內出現枕部或額部的鈍痛或搏動性痛，起坐或站位時頭痛加劇，平卧後好轉。一般在1～3天內自然恢復，少數病例可持續更長時間。可有眩暈和嘔吐，嚴重者可有意識障礙。
腰穿時應選用口徑細的穿刺針，術後去枕平卧6小時有利於預防頭痛。