假若雌激素分泌失調，或各種雌激素之間比例失衡，就可能出現生殖生理和主觀感覺方面的異常反應。雌激素偏低能影響卵子發育;各種雌激素比例失衡會引起月經前腹脹、頭痛、情緒起伏、敏感易怒，還能引起月經不調。此外，如果雌激素水平下降幅度太快，還會造成更年期特有的不適癥狀。最後，缺乏雌激素還會加速骨質流失，增加患心臟病的風險。
缺乏雌激素的原因是卵巢功能低下。
更年期女性，由於卵巢功能下降，雌激素大量減少，可引發一系列癥狀：
皮膚差：彈性差、皺紋深、色斑多、無光澤、常起皮、易過敏;
贅肉多：身材臃腫，虎背熊腰，大腹便便，腰、腹、臀、腿全是多餘的贅肉;
胸變形：乳房發育不良、下垂、萎縮、乾癟、大小不一、乳暈發黑;
性慾低：陰道乾澀、彈性差、分泌物少、性交疼痛;
炎症來：外陰瘙癢，下身有異味，各種陰道炎、尿道炎接踵而來;
經不順：月經紊亂，周期過長，過短，經血過多或過少，痛經、絕經;
易缺鈣：鈣流失嚴重，腰酸腿疼、彎腰駝背、腿型不直、易骨折、牙齒鬆動;
病不斷：不孕不育、高血壓、冠心病、視力低下，各種增生、腫瘤;
注意鑒別因病理性造成的雌激素分泌不足與因更年期等身體生理上的分泌不足。
更年期女性，由於卵巢功能下降，雌激素大量減少，可引發一系列癥狀：
皮膚差：彈性差、皺紋深、色斑多、無光澤、常起皮、易過敏;
贅肉多：身材臃腫，虎背熊腰，大腹便便，腰、腹、臀、腿全是多餘的贅肉;
胸變形：乳房發育不良、下垂、萎縮、乾癟、大小不一、乳暈發黑;
性慾低：陰道乾澀、彈性差、分泌物少、性交疼痛;
炎症來：外陰瘙癢，下身有異味，各種陰道炎、尿道炎接踵而來;
經不順：月經紊亂，周期過長，過短，經血過多或過少，痛經、絕經;
易缺鈣：鈣流失嚴重，腰酸腿疼、彎腰駝背、腿型不直、易骨折、牙齒鬆動;
病不斷：不孕不育、高血壓、冠心病、視力低下，各種增生、腫瘤;
雌激素偏低的治療 激素療法誕生於上世紀四十年代，主要用於改善更年期綜合症，僅在美國就有超過40% 的更年期婦女服用雌性激素替代藥物。但在我國僅有1%的更年期婦女接受雌激素療法。公眾對這種治療手段還不熟悉，特別是有些更年期綜合症患者對治療的安全性有顧慮。目前歐美國家女性流行利用阿若婭進行補充調節,並達到美容的效果,延緩衰老。尤其是口服類的補充治療，可能會帶來癌變。
在國外，婦女服用雌激素有幾十年的歷史，雌激素確實在改善更年期婦女的生活質量方面起到很大作用。因為雌激素治療的好處曾一度被誇大，使用範圍被擴大，曾經造成濫用。1997年國女性健康啟動研究協會進行了一項臨床實驗，結果表明長期使用雌激素會對婦女增加心腦血管疾病及乳腺癌的風險。