生理性閉經屬於正常現象。正常月經周期的維持，需依賴下丘腦——垂體——卵巢功能的協調和子宮內膜對性激素的周期性反應。上述環節中任何一處發生問題，即可能引起閉經。閉經患者絕大多數無排卵，因而不能受孕。除生理性閉經(見於青春期前女孩、絕經期後婦女和孕婦)外，其他的閉經皆屬病理性的。
青春期發育的早期，在初來月經的二三年內，由於卵巢功能尚不穩定，月經周期往往不規則;受孕後的婦女，由於卵巢黃體產生大量黃體素，刺激子宮內膜不斷增生而不脫落，所以就不會來月經;分娩以後，卵巢功能恢復需要一定時間，加之哺乳對卵巢的抑制，月經的恢復更晚;婦女到40歲以後，由於卵巢功能的逐漸衰退，月經經常數月一次直至絕經。這種在發育期、妊娠期、哺乳期和絕經期所發生的閉經稱為生理性閉經，屬於正常現象。
生理性閉經的臨床表現
(1)青春前期閉經：女孩6～9歲可從尿中查出去氫表雄酮(DHEA)及其硫酸鹽，10歲起迅速升高，此乃腎上腺功能初現的表現，來源於腎上腺的雄激素促使陰毛、腋毛出現，身材迅速長高，因為下丘腦-垂體-卵巢軸尚待進一步發育完善，雌激素水平尚低，子宮內膜增殖較差，還不會引起出血，故月經推遲來潮。初潮前這一階段未見月經來潮屬於生理現象，有些女孩在初潮後尚有一年半載的月經數月來潮一次，且為無排卵月經也屬正常。
(2)哺乳期閉經：母乳餵養的婦女在任何時候斷奶，則常在斷奶後2個月恢復月經。
(3)絕經過渡期及絕經後閉經：絕經過渡期可能數月出現一次子宮出血，絕經後生殖器官逐漸萎縮，子宮也縮小。
可以根據上面的臨床表現進行診斷。
病理性閉經的臨床表現
(1)子宮性閉經及隱經：
①無孔處女膜：臨床癥狀逐漸出現，最初可感周期性下腹墜脹、疼痛，進行性加重，血腫壓迫尿道及直腸，可引起排尿及排便困難、恥骨上痙攣性疼痛、肛門墜脹、尿頻、尿急、尿痛，甚至點滴狀排尿。當宮腔大量積血時，可導致輸尿管移位、扭曲、積水，甚至腎盂積水。經血逆流入盆腔時，可刺激腹膜產生劇烈腹痛。腹部檢查時可捫及一觸痛明顯的包塊，有深壓痛，少數患者可有輕度肌緊張，反跳痛。婦科檢查時發現，處女膜變薄膨出，無開口，表面呈紫藍色。肛診可觸及陰道血腫，子宮增大、觸痛，雙附件為臘腸樣條狀包塊、觸痛。病程長者可有不規則增厚，數目不等的觸痛結節。B型超聲或CT檢查可探及陰道桶狀囊實性腫塊，宮腔及輸卵管內積液。
②先天性無陰道：本症常因青春期不來月經，或出現周期性下腹疼痛，或婚後性交困難，或不孕，就診時檢查發現。乳房、第二性徵及外生殖器發育正常，卵巢功能正常;基礎體溫(BBT)呈雙相型，血生殖激素測定呈育齡婦女周期性變化。若伴有子宮缺如或始基子宮，可無癥狀;若有子宮有功能的內膜存在，則可能因宮腔積血有進行性加重的周期性下腹疼痛。婦科檢查時可發現外陰無陰道口，若婚後較長時間才就診者，可發現前庭區有一因性交而形成的淺窩。大多數患者盆腔內可觸及一條索狀痕迹子宮。若患者存在有功能的子宮內膜，年齡較小而就診者檢查時可發現一小子宮，或可觸及正常或增大的痛性子宮，有時可觸及臘腸樣增粗的輸卵管。B超、CT等影像學檢查可以證實上述發現，並可發現泌尿系統畸形。
③陰道橫隔：不完全橫隔者，因經血可經小孔流出，故無閉經。完全性橫隔者因經血排出障礙，出現原發性閉經、周期性下腹疼痛等表現。
完全性陰道中、上段橫隔者婦科檢查時可發現有一定長度、寬度的陰道下段，頂端封閉、觸及一有波動感的隔膜，其上方陰道擴張，似有囊性感。陰道下段橫隔有時不易與陰道閉鎖區別，仔細的婦科檢查結合隔後腔穿刺是有效的鑒別方法。
④陰道閉鎖：臨床表現為原發性閉經、周期性下腹疼痛等。婦科檢查見外陰發育不良，處女膜無孔，但表面色澤正常，無向外膨隆征，肛診時可發現在距外陰3cm左右的上方有一突向直腸的陰道囊性包塊，腹痛時包塊張力大。經腹或經直腸B超探查可在距肛門3～4cm上方探及一囊性桶狀包塊，在B超引導下經外陰向腫塊穿刺，可抽出陳舊暗紅色血液或巧克力樣糊狀物。Ⅱ型者陰道完全閉鎖，臨床表現也為原發性閉經、周期性下腹疼痛等。婦科檢查在盆腔一側或較高處有直徑4～8cm的包塊，為畸形的子宮或附件腫物。
⑤宮頸閉鎖：若患者無子宮內膜，僅表現為原發性閉經，若有子宮內膜，其臨床表現與先天性無陰道相似。
⑥先天性無子宮：臨床表現為原發性閉經，肛腹診捫不到子宮，B超、CT及MRI亦不能探及子宮的存在。
⑦始基子宮：患者表現為原發性閉經，肛診及B超等影像學檢查可發現一小子宮，僅2～3cm長，腹腔鏡檢或剖腹手術時可見一扁平實心，0.5～1cm厚的子宮痕迹。
⑧米勒管發育不全綜合征：表現為原發性閉經，生殖道的缺陷包括先天性無陰道，子宮可正常，也可為各種發育畸形，包括雙角子宮、單角子宮、始基子宮、殘角子宮、雙子宮等，罕為先天性無子宮。該征患者卵巢發育及功能均正常，因此第二性徵發育正常。約34%的患者合并泌尿道畸形，12%有骨骼畸形，7%有腹股溝疝，4%存在先天性心臟病。若為雙子宮、雙角或單角子宮、殘角子宮，則不引起閉經。
⑨創傷性宮腔粘連：臨床表現與粘連部位和程度有一定關係，但二者間不完全一致。月經量少、經期縮短、閉經、不孕、流產及產科併發症是主要臨床癥狀。在宮腔手術後月經量減少或閉經，尤其是在產後1周子宮內膜再生時刮宮或人工流產手術後易於損傷內膜或葡萄胎患者連續多次清宮術後。部分患者有周期性腹痛，雙合診可捫得子宮稍大或正常大，有輕壓痛及雙附件區壓痛。宮頸內口粘連的患者多為人工流產術後即閉經，部分患者因宮腔積血和經血逆流入腹腔可表現為腹痛，宮頸舉痛，宮體增大壓痛，陰道後穹隆穿刺抽出暗紅色不凝血液，表現類似異位妊娠。宮腔探針檢查可發現宮頸內口阻塞或狹窄，探針沿子宮屈曲方向及子宮腔軸向前進時，粘連輕者可在受阻後有突破感之後進入宮腔，同時可能有少量暗紅色很稠的血液流出。如為宮腔粘連，探針進入宮腔後感到活動受限。宮頸內口嚴重粘連者則探針不能進入內口，需在持續骶神經阻滯麻醉下進行探宮頸口，這種嚴重的宮頸內口粘連也可發生在非妊娠子宮患者作子宮頸激光或電烙時，手術傷及宮頸管內膜及內口。
(2)卵巢性閉經：
①Turners綜合征：A.16歲後仍無月經來潮;B.身材矮小、第二性徵發育不良、蹼狀頸、盾胸、肘外翻;C.高促性腺激素，低性腺激素;D.染色體核型為45，XO;46，XX/45，XO;45，XO/47，XXX。
②先天性性腺發育不良：染色體核型和身高正常，第二性徵發育大致正常。余同Turner』s綜合征。
③卵巢早衰：A.40歲前絕經;B.高促性腺激素和低性腺激素;C.約20%左右有染色體核型異常;D.約20%伴有其他自身免疫性疾病;E.病理檢查提示卵巢中無卵泡或僅有極少原始卵泡;F.腹腔鏡檢查見卵巢萎縮;G.有醫源性損壞卵巢的病史;H.對內源性和外源性促性腺激素刺激無反應;I.氯米酚試驗，於周期第5天起，口服氯米酚50～100mg，1次/d，共5天。於周期第3天和10天分別測血清FSH，如第10天FSH值>20U/L，提示卵巢功能低下。
④抵抗綜合征：A.原發或繼發性閉經;B.高促性腺激素和低性腺激素;C.病理檢查提示卵巢中有多量始基卵泡和未成熟卵泡;D.腹腔鏡檢查見卵巢大小正常，但無生長卵泡和排卵痕迹;E.對內源性和外源性促性腺激素刺激無反應。
⑤多囊卵巢綜合征：臨床表現可見有月經稀發、閉經、不孕的慢性無排卵現象;有多毛、痤瘡和黑棘皮病等高雄激素血征現象;肥胖。
(3)垂體性閉經：
①垂體腫瘤和高泌乳素血症：臨床表現可見閉經或月經不調;泌乳;如垂體腫瘤較大可引起頭痛和視力障礙;如為空蝶鞍綜合征可有搏動性頭痛;排除服藥引起的高泌乳素血症。
②垂體功能衰竭：臨床表現可見有產後大出血或垂體手術的病史;消瘦、乏力、畏寒、蒼白，產後無乳汁分泌，無性慾，無卵泡發育，生殖道萎縮;檢查有性激素水平低下及甲狀腺功能低下和腎上腺功能低下的癥狀、體征。
(4)中樞和下丘腦性閉經：
①單一促性腺激素釋放激素低下：A.原發性閉經，卵泡存在但不發育;B.有的患者有不同程度的第二性徵發育障礙;C.Kallmann』s患者伴嗅覺喪失;D.FSH、LH、E2均低下;⑤對GnRH治療有反應;⑥X染色體(Xp22.3)的KAL基因缺陷。
②功能性下丘腦性閉經：A.閉經或不規則月經;B.常見於青春期或年輕女性，多有節食、精神緊張、劇烈運動及不規律生活史;C.體型多瘦弱;D.TSH水平正常，T3和T4較低;E.FSH和LH偏低或接近正常，E2水平偏低;F.超聲檢查提示卵巢正常大小，多個小卵泡散在分布，髓質反光不增強。
生理性閉經的臨床表現
(1)青春前期閉經：女孩6～9歲可從尿中查出去氫表雄酮(DHEA)及其硫酸鹽，10歲起迅速升高，此乃腎上腺功能初現的表現，來源於腎上腺的雄激素促使陰毛、腋毛出現，身材迅速長高，因為下丘腦-垂體-卵巢軸尚待進一步發育完善，雌激素水平尚低，子宮內膜增殖較差，還不會引起出血，故月經推遲來潮。初潮前這一階段未見月經來潮屬於生理現象，有些女孩在初潮後尚有一年半載的月經數月來潮一次，且為無排卵月經也屬正常。
(2)哺乳期閉經：母乳餵養的婦女在任何時候斷奶，則常在斷奶後2個月恢復月經。
(3)絕經過渡期及絕經後閉經：絕經過渡期可能數月出現一次子宮出血，絕經後生殖器官逐漸萎縮，子宮也縮小。
可以根據上面的臨床表現進行診斷。
1、月經過少或月經後期都可發展為閉經，積極治癒月經過少或後期，可以減少閉經的發病率。
2、明確閉經的病因和部位，對治療閉經的效果與預後估計有一定的參考價值。如下丘腦性閉經，由精神因素、環境改變、營養不良等引起，藥物治療預後較佳。又如由結核桿菌引起的子宮性閉經，子宮內膜已被破壞，恢復月經的可能性較少。又如用孕激素試驗陽性的(用黃體酮後能轉經)，預後較好。
3、閉經伴不孕者因家庭、個人和周圍環境的影響而精神抑鬱，臨床檢查與化驗無明顯異常，對這些患者在藥物治療同時精神安慰和鼓勵，一旦大腦皮質抑制解除，內分泌功能恢復正常而受孕。也有領養一個小孩後，患者很快懷孕，這是常見的典型例子。
4、中醫文獻中有終生不來月經而受孕者，稱為「暗經」的，對此需要謹慎，用藥前要仔細詢問病史。
5、目前服用減肥藥的婦女為數不少，有部分婦女由此而閉經，也有因肥胖而節食，導致厭食而閉經，還有多次人流手術而閉經，以上閉經都是可以預防的，有些藥物必須在醫生指導下服用，防止其不良反應。
6、對頑固性閉經單用中藥或西藥效果不佳者可採用中西藥結合周期治療，待起效後逐漸減少西藥劑量，最終中醫治療。