除骨和牙齒外，在機體的其他組織發生鈣鹽沉著的現象，稱病理性鈣化。沉著的鈣鹽主要是磷酸鈣，其次是碳酸鈣。
病理性鈣化的病因如下。
1.腫瘤性：
①顱咽管瘤;②膠質瘤;③腦膜瘤;④室管膜瘤;⑤脈絡叢乳頭狀瘤;⑥脊索瘤;⑦皮樣囊腫;⑧表皮樣囊腫;⑨畸胎瘤;⑩錯構瘤;⑨脂肪瘤;⑩垂體腺瘤(少見);⑩轉移瘤(少見)。
2.血管性：
①動脈粥樣斑;②動脈瘤;③血管瘤;④硬膜下血腫;⑤顱內血腫;⑥腦梗死。
3.感染性：
①結核病;②先天性顱內感染;③囊蟲病;④棘球(蚴)囊腫;⑤旋毛蟲病;⑥隱球菌病;⑦球孢子菌病。
4.先天性及遺傳性：
①結節性硬化症;②Stureg-Weber綜合征;③神經纖維瘤病;④無腦回畸形;⑤Fahr病;⑥Cockayne綜合征;⑦Gor1in-Goltz綜合征。
5.代謝性及其他原因：
①甲狀旁腺功能減退症;②假性甲狀旁腺功能減退症;③X射線輻射;④氨甲蝶呤;⑤血液透析;⑥甲狀旁腺功能亢進;⑦維生素D中毒;⑧一氧化碳中毒;⑨鉛中毒;⑩系統性紅斑狼瘡;○11Down線粒體病;○12AIDS。
【臨床表現】癥狀和體征的出現與否取決於是否存在潛在疾病及病變性質、鈣化的部位及範圍。生理性顱內鈣化通常無癥狀，多在行影像學檢查時無意中被發現。病理性顱內鈣化的臨床表現決定於原發病的性質(腦腫瘤、血管性異常、炎性病變及代謝異常等)。基底節鈣化(特發性或繼發性)通常是無癥狀性，但有些患者可能出現異常運動(舞蹈症、手足徐動症、肌張力障礙等)和帕金森樣癥狀(肌強直、運動減少等);小腦鈣化患者可出現小腦征;在某些患者中，還可出現認知功能障礙。對原發疾病的治療有時可使顱內鈣化減輕或消失。
【診斷】顱內鈣化可由CT掃描、MRI成像及頭顱平片發現，在新生兒也可由顱內超聲來顯示。其中，CT是發現顱內鈣化最敏感的方法，顯示顱內鈣化的效果最好，在CT上表現為高密度(如同骨質密度)。
MRI在顯示鈣化方面不如CT敏感。鈣化在MRI上的信號隨著病灶局部成分的不同而各異：如鈣化成分大於30%，由於主要是低的質子信號效應，鈣化則傾向於低信號;鈣化成分不足 30%時，由於Tl的縮短，鈣化灶在T1相上也可能表現為高信號。由於通常鈣化灶在MRI表現為低信號或無信號，其中信號減低在T1和T2加權相及在梯度回波序列上顯示的較明顯，而信號丟失在梯度回波序列上顯示得更明顯。
病理性鈣化可分為營養不良鈣化和轉移性鈣化兩種類型。前者主要發生在局部組織變性壞死的基礎上。由於局部組織的理化環境改變而促使血液中鈣、磷離子發生沉積。後者發生在高血鈣的基礎上。當血液中鈣離子濃度升高時，鈣鹽可沉著在多處健康的器官與組織。兩種鈣化的形態表現基本相同，但其發生機理及對機體的影響則不同。
【臨床表現】癥狀和體征的出現與否取決於是否存在潛在疾病及病變性質、鈣化的部位及範圍。生理性顱內鈣化通常無癥狀，多在行影像學檢查時無意中被發現。病理性顱內鈣化的臨床表現決定於原發病的性質(腦腫瘤、血管性異常、炎性病變及代謝異常等)。基底節鈣化(特發性或繼發性)通常是無癥狀性，但有些患者可能出現異常運動(舞蹈症、手足徐動症、肌張力障礙等)和帕金森樣癥狀(肌強直、運動減少等);小腦鈣化患者可出現小腦征;在某些患者中，還可出現認知功能障礙。對原發疾病的治療有時可使顱內鈣化減輕或消失。
【診斷】顱內鈣化可由CT掃描、MRI成像及頭顱平片發現，在新生兒也可由顱內超聲來顯示。其中，CT是發現顱內鈣化最敏感的方法，顯示顱內鈣化的效果最好，在CT上表現為高密度(如同骨質密度)。
MRI在顯示鈣化方面不如CT敏感。鈣化在MRI上的信號隨著病灶局部成分的不同而各異：如鈣化成分大於30%，由於主要是低的質子信號效應，鈣化則傾向於低信號;鈣化成分不足 30%時，由於Tl的縮短，鈣化灶在T1相上也可能表現為高信號。由於通常鈣化灶在MRI表現為低信號或無信號，其中信號減低在T1和T2加權相及在梯度回波序列上顯示的較明顯，而信號丟失在梯度回波序列上顯示得更明顯。
營養正常、飲食正常。治療性干預，以最大限度地清除鈣化碎片粒子。